Штамм
Отнесение микроорганизма к определённому виду происходит на основе достаточно широких признаков, таких как тип нуклеиновой кислоты и строение капсида у вирусов; способности расти на определённых углеводородах и тип выделяемых продуктов обмена веществ, а также консервативных последовательностях генома у бактерий. Внутри вида существуют вариации относительно, размера и формы бляшек (негативные «колонии» вируса) или колоний микроорганизма, уровню продукции ферментов, наличию плазмид, вирулентности и т. п.
В мире не существует общепризнанной номенклатуры названия штаммов, и используемые названия достаточно произвольны. Как правило, они состоят из отдельных букв и цифр, которые записываются после видового названия. Например, один из самых известных штаммов кишечной палочки — E. coli K-12.
См. также
Примечания
Литература
Полезное
Смотреть что такое «Штамм» в других словарях:
штамм — штамм, а … Русский орфографический словарь
штамм — штамм/ … Морфемно-орфографический словарь
штамм — а; м. [нем. Stamm] Биол. Чистая культура микроорганизмов одного вида, выделенная из какого л. источника и обладающая особыми свойствами (используется в медицине, биологии, пищевой промышленности и т.п.). * * * штамм (нем. Stamm), чистая культура… … Энциклопедический словарь
ШТАММ — [нем. Stamm] биол. в микробиологии: чистая культура микроорганизмов данного вида, выделенная из определенного источника. Словарь иностранных слов. Комлев Н.Г., 2006. штамм (нем. stamm) в микробиологии чистая культура микроорганизмов или вирусов… … Словарь иностранных слов русского языка
штамм — чистая культура микроорганизма, выделенная из определенного источника или полученная в результате мутаций. Разные Ш. одного и того же микроорганизма могут отличаться рядом свойств, напр. вирулентностью, чувствительностью к антибиотикам. Ш.… … Словарь микробиологии
Штамм — ШТАММ, (немецкое Stamm), полученная в результате размножения одной клетки совокупность генетически однородных клеток микроорганизмов (или культивируемых клеток эукариот), отличающаяся по определенным признакам от других совокупностей (штаммов)… … Иллюстрированный энциклопедический словарь
ШТАММ — (нем. Stamm) чистая культура микроорганизмов одного вида, у которого изучены морфологические и физиологические особенности. Разные штаммы микроорганизмов одного и того же вида по ряду свойств (напр., чувствительность к антибиотикам) отличаются… … Большой Энциклопедический словарь
штамм — штамм, а (биол.) … Русское словесное ударение
Штамм — м. Чистая культура микроорганизмов, выделенная из какого либо одного источника организма заболевшего животного или человека, из почвы, воды и т.п. и используемая для изготовления вакцин и сывороток. Толковый словарь Ефремовой. Т. Ф. Ефремова.… … Современный толковый словарь русского языка Ефремовой
штамм — сущ., кол во синонимов: 1 • субштамм (1) Словарь синонимов ASIS. В.Н. Тришин. 2013 … Словарь синонимов
Поиск ответа
| Вопрос № 227498 |
Ответ справочной службы русского языка
Если имеются в виду кавычки при прямой речи, то нередко в газетных текстах кавычки опускают. О знаках при прямой речи см. в http://spravka.gramota.ru/pravila.html?znp.htm [Правилах].
Ответ справочной службы русского языка
Ответ справочной службы русского языка
1. Да, даже в этом случае. 2. «Сбербанк» и «Уралсиб» заключаются в кавычки при наличии родового слова.
Здравствуйте, подскажите, пожалуйста, нужны ли кавычки при написании названий штаммов?
Ответ справочной службы русского языка
Если Вы имеете в виду названия, которые пишутся латиницей и цифрами, то кавычки не нужны.
Нужно ли ставить кавычки при написании западных или псевдозападных торговых марок? Например, при написании SONY, Adidas, Vip-program, Banquete-Hall. Заранее спасибо за ответ.
Ответ справочной службы русского языка
Названия латиницей, как правило, в кавычки не заключаются.
Ответ справочной службы русского языка
Да, название заключается в кавычки.
Скажите пожалуйста, нужны ли кавычки при написании названий аэропортов и железнодорожных линий (например, линия Сеул-Пусан)
Ответ справочной службы русского языка
Ответ справочной службы русского языка
Названия, написанные латиницей, в кавычки при нято не заключать: _газета The Sun_.
Здравствуйте! Подскажите, следует ли ставить кавычки при написании исторических названий мест отправления культа (например: мечеть Аль-Акса в Иерусалиме)? Заранее благодарю
Ответ справочной службы русского языка
Здравствуйте! Подскажите, пожалуйста, нужны ли кавычки при упоминании всероссийского дня студента, например, поздравляем с «Татьяниным днем»?
Ответ справочной службы русского языка
Ответ справочной службы русского языка
Названия звезд и планет в кавычки не заключают: звезда Солнце, звезда Михаил.
Скажите, пожалуйста,сохраняются ли кавычки при сокращении названий партий: «ЕР» или ЕР от «Единая Россия»? Бережная
Ответ справочной службы русского языка
Аббревиатуру в кавычки заключать не следует.
Ответ справочной службы русского языка
Неправильно, кавычки при указании поезда не нужны.
Ответ справочной службы русского языка
Возможен первый вариант, а также вариант: _И я все время задаюсь вопросом: Почему именно я?_ (в газетных текстах кавычки при прямой речи можно опустить).
Ответ справочной службы русского языка
Использование кавычек зависит от контекста. Например: _он болен сибирской язвой_, но: _ему поставили диагноз «сибирская язва»_.
Как писать научные названия видов бактерий в журнальных статьях (часть 2)
Исследования могут быть достаточно сложными и без того, чтобы беспокоиться еще и о правильности использования микробной номенклатуры или научных названий бактерий. Написание названий бактерий в научной статье может быть большой проблемой для ученых, поскольку руководящие принципы постоянно изменяются, отражая новые открытия. Кроме того, запутанными могут быть и латинские названия. В первой статье в этой серии мы обсудили эффективные советы по написанию научной номенклатуры растительного и животного мира. Эта статья предоставляет рассмотрение самых больших проблем, с которыми сталкиваются исследователи при использовании микробной номенклатуры, и несколько советов, которые помогут вам не сбиться с пути.
Как называются бактерии?
Международный комитет по систематике прокариот (ICSP) разработал руководящие принципы, которые объясняют правильную номенклатуру или систему именования бактерий. Эта система известна как Бактериологический кодекс. У бактерии есть двойное название, состоящее из двух частей: название рода, которое указывает, к какому роду она принадлежит, и видовой эпитет.
При упоминании бактерии в статье автор должен подчеркнуть название в тексте или выделить его курсивом. После написания полного названия микроорганизма в первом упоминании, название рода можно сократить до заглавной буквы.
ICSP рекомендует в реферате вашей публикации снова изложить полное название любой бактерии.
При обсуждении безымянных видов используется аббревиатура «sp.» для обозначения одного безымянного вида, в то время как написание «spp.» после рода относится к более, чем одному безымянному виду.
Бактерии часто разделяются на подвиды, которые указываются при помощи таких систематических категорий, как биовар, хемоформ, хемовар, культивар, морфовар, патовар, серовар и состояние.
Эти категории следует писать в виде простого текста, перед дополнительным именем, выделенном курсивом или подчеркнутом. Например, «Rhizobium leguminosarum biovar viciae» правильно писать как Rhizobium leguminosarum биовар viciae.
Общие проблемы при использовании микробной номенклатуры
Тем не менее, есть некоторые общие проблемы, с которыми сталкиваются исследователи при использовании микробной номенклатуры. Во-первых, как вы уже догадались, различные виды бактерий, если их названия сокращены, могут выглядеть одинаково.
М. bovis может указывать на Moraxella bovis, Mycoplasma bovis, или же на Mycobacterium bovis.
В этом случае автору следует просто позаботиться о том, чтобы либо не использовать аббревиатуры, которые можно перепутать, либо обязательно четко указать, какая бактерия обсуждается.
Другие проблемы, с которыми сталкиваются исследователи в отношении микробной номенклатуры, являются более сложными. Хотя Бактериологический Кодекс часто интерпретируется как «официальный» список действительных названий для бактерий, Кодекс содержит только рекомендации по вопросу, как должны называться бактерии. Это допускает разногласия, а также открытия и эволюцию в научных исследованиях. Например, одна группа исследователей может отнести бактерию к роду A. Аналогичным образом, другая группа исследователей может провести другое исследование и прийти к выводу, что та же бактерия относится к роду B. Продолжая наш предыдущий пример видов bovis, одна и та же бактерия может быть названа А bovis в одной статье и B bovis в другой.
Как узнать, действительна ли микробная номенклатура, которой я пользуюсь?
Многие исследователи ошибочно полагают, что самое последнее опубликованное название – это «правильное» название. На самом деле, как мы видели выше, это не так. Название должно быть опубликовано в статье в Международном журнале систематической и эволюционной микробиологии (International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology). Оно также может быть опубликовано в другом месте, если название объявлено в Ратификационных списках (Validation lists). Иными словами, микробная номенклатура – это вопрос научного суждения и консенсуса.
Например, название Helicobacter pylori было немедленно принято научным сообществом в качестве замены Campylobacter pylori, тогда как название Tatlockia micdadei не было принято повсеместно в качестве замены Legionella micdadei.
Наконец, ICSP не дает конкретных рекомендаций о том, как указывать таксоны после подвида, такие, как обозначение штамма. Обозначение штамма должно следовать за родом и видом и обычно представляет собой комбинацию цифр и букв.
Например, вы можете написать Helicobacter pylori K164: K7, при этом K164: K7 указывает конкретный штамм бактерий, используемых в вашей работе.
Если вы сомневаетесь в правильности использования микробной номенклатуры в своей статье, вашей первой остановкой должен быть Международный кодекс номенклатуры бактерий (редакция 1990 г.). Будьте в курсе соответствующих публикаций в вашей области и будьте в курсе любых разногласий или новых открытий, касающихся классификации бактерий. Наконец, помните, что действительные имена являются предметом научного суждения и консенсуса.
Была ли эта статья полезна? С какими еще проблемами вы столкнулись при использовании микробной номенклатуры в своих научных работах? Сообщите нам об этом в комментариях!
Симптомы «омикрона»: Как отличить заражение новым штаммом от «дельты»
Штамм коронавируса «омикрон», у которого вдвое больше мутаций в S-белке, чем у «дельты», уже считается крайне заразным (один больной может заразить 3-3,5 человека против 0,8 у «дельты») и был обнаружен почти в 80 странах мира. Точно отличить один штамм от другого помогут медицинские анализы, однако есть ряд симптомов, которые могут облегчить определение варианта вируса.
В отличие от омикрона, заражение «дельтой» (этот штамм сейчас, наряду с оригинальным уханьским штаммом коронавируса, доминирует в Москве) характеризуется головной болью, болью в горле и насморком, то есть классическими признаками ОРВИ, пишет The Telegraph. Приложение ZOE tracker, разработанное Королевским колледжем Лондона, зафиксировало наиболее частые жалобы пациентов, такие как пульсирующая головная боль от умеренной до сильной сроком до пяти дней, которую сложно унять обезболивающими.
Во время первых трех волн заболеваемости коронавирусом 100% пациентов, госпитализированных в одно из крупнейших частных учреждений ЮАР, нуждались в кислороде. Текущая волна заболеваемости в ЮАР показывает, что в нем нуждаются только 10% пациентов в больнице, пишет британское издание. При этом в 90% случаях «омикрон» был выявлен случайно, то есть пациент обращался в клинику не из-за коронавируса.
Пока что все зараженные на территории РФ переносят заболевание в легкой форме или даже без симптомов, часть заболевших была ранее привита, сообщала глава Роспотребнадзора Анна Попова.
Чтобы обезопасить себя и близких от заражения, врачи рекомендуют привиться полным циклом против коронавирусной инфекции. Если ранее вы болели COVID-19 или уже были привиты, то стоит пройти ревакцинацию одним уколом, если после последней вакцинации или после болезни прошло более полугода. По данным ученых, это должно привести к всплеску выработки антител, которые защитят от тяжелого течения болезни.
Какие штаммы коронавируса есть и чем они отличаются?
Рассказываем, о каких штаммах коронавируса известно и чем они опасны.
– Слышала про какой-то новый опасный штамм коронавируса, из-за которого якобы человек может остаться без ног. Неужели это правда? Какие вообще есть штаммы коронавируса и следует ли их опасаться?
По данным опубликованным на GISAID (ресурс, который обеспечивает открытый доступ к геномным данным вирусов гриппа и коронавируса, ответственного за пандемию COVID-19 – прим. ред.), каждый вирус имеет свой геном – уникальную специфическую последовательность ДНК или РНК. Коронавирус SARS-CoV-2 относится к группе РНК-вирусов, довольно сложный геном которых зашифрован в длинной молекуле рибонуклеиновой кислоты (РНК).
Когда вирус воспроизводит копии самого себя, он иногда немного изменяется. Эти изменения называются «мутациями». Используя слово «штамм», учёные подразумевают генетически отличную ветвь вируса, отличающуюся одной или несколькими мутациями от своего «родителя».
По мере развития пандемии COVID-19, вызывающий заболевание коронавирус SARS-CoV-2 мутирует. Так, его штаммы могут представлять большую угрозу для человека, например, легче передаваться или вызывать более тяжёлое заболевание.
Началась пандемия со штамма L – именно его обнаружили в китайском Ухане в декабре 2019 года, в настоящее время классическая версия вируса постепенно исчезает.
Остальные штаммы распределены в странах мира с разной интенсивностью: на каждом континенте, как правило, существует не больше двух основных вариаций. Их распространение можно наблюдать на интерактивной карте Nextstrain, отслеживающей мутации вируса.
В настоящее время учёные выделяют 4 наиболее опасных штамма COVID-19.
Фото: Александр Плонский/ТАСС
Британский штамм – «Альфа»
Новую генетическую линию коронавируса SARS-CoV-2 – B.1.1.7 впервые зафиксировали осенью 2020 года в Великобритании. Она является одним из самых распространённых в странах Европы вариантов коронавируса, но не в России.
Этот штамм распространяется на 56-70% быстрее исходника. Некоторые учёные предполагают, что эта разновидность коронавируса приводит к смерти пациентов – на 30-70% чаще, чем классический штамм COVID-19. Однако в апреле 2021 года в журнале Lancet опубликовали исследование, специалисты которого не смогли подтвердить эту теорию. Также в учёные опровергли предположение об увеличении рисков повторно заразится этим штаммом, хотя и подтвердили, что альфа-вирус более заразен.
В Роспотребнадзоре заявили, что британский штамм коронавируса принципиально не отличается от «уханьского» или других штаммов, так как при мутации не произошло и 1% изменения в его геноме. И российские вакцины «Спутник V» и «ЭпиВакКорона» достаточно эффективны против этого штамма.
Доказано, что инфицированные британским штаммом редко теряют вкус и обоняние. В основном у заразившихся им распространены кашель, боль в горле, усталость, мышечные боли и лихорадка.
Фото: Министерство здравоохранения кировской области
Южноафриканский штамм – «Бета»
Новый вариант коронавируса SARS-CoV-2 501Y.V2/B.1.351, известный как «южноафриканский» штамм, впервые выявили в ЮАР в декабре 2020 года.
По информации Национального института инфекционных заболеваний в Йоханнесбурге, мутации нового варианта SARS-CoV-2 делают его устойчивым к антителам в плазме крови, донорами которой были пациенты, уже переболевшие коронавирусной инфекцией.
Бета-штамм активно распространяется среди молодых людей, так как способен лучше прикрепляться к клеткам организма. Болезнь при заражении именно этим штаммом протекает без каких-либо сопутствующих заболеваний и чаще приводит к серьёзным осложнениям.
В феврале 2021 года повышенную заразность штамма из ЮАР подтвердила Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ).
Бразильский штамм – «Гамма»
В январе 2021 года в Бразилии ученые сообщили о возникновении нового штамма коронавируса – B.1.1.248. Именно гамма-вариант стал причиной второй волны коронавируса в столице штата, городе Манаус. О его заразности говорит Что немало говорит о его заразности – около 70% жителей города ранее переболели оригинальным вариантом коронавируса и имело антитела, в том числе это связано и с антипрививочными взглядами президента страны Жаира Болсонару.
По данным экспертов, штамм является более заразным и опасным для молодых людей, а также снижает эффективность вакцин. При гамма-штамме болезнь имеет стандартные симптомы ковида, но сам вирус минимум гораздо заразнее исходного варианта. Также он умеет преодолевать естественный иммунитет уже переболевшего населения. Установлено, что бразильский вариант тяжелее протекает у молодёжи и беременных женщин.
В России гамма-вариант пока представлен единичными случаями. Как заявили 22 июля представители центра «Вектор», во всей стране выявили всего несколько случаев гамма-варианта. Зато, по данным американского Центра по контролю и профилактике заболеваний, этот вариант быстро распространился в США.
Индийский штамм – «Дельта»
Сегодня в мире доминирует именно дельта-штамм (B.1.617). В ВОЗ и Европейском центре по профилактике и контролю заболеваний считают, что он будет преобладать в мире и в ближайшие месяцы, так как его уже идентифицировали почти во всех европейских странах. Этот штамм впервые выявили в индийском городе Напур в октябре 2020 года.
Врачи считают, что этот штамм более заразен и способен избегать нейтрализации некоторыми моноклональными антителами (антитела, произошедшие из одной плазматической клетки-предшественницы – прим. ред.). Это значит, что антитела, появившиеся у переболевшего COVID-19 человека, могут быть не эффективны в борьбе со штаммом дельта.
Руководитель Екатеринбургского НИИ вирусных инфекций «Вектор» Роспотребнадзора Александр Семенов считает, что вирус дельта, сменив классический уханьский штамм, по течению болезни стал более гриппоподобным. Больные индийским штаммом чаще жалуются на головную боль, боль в горле, повышенную температуру, кашель и насморк, для них совсем не характерна потеря обоняния. Молодые и здоровые люди легко могут принять заражение дельта-штаммом за простуду. Но вместе с тем пациенту может стать хуже буквально за два-три-четыре дня.
Для течения средней тяжести болезни дельта вирусом характерны следующие характеристики: сильные боли в суставах, сильные боли в животе, тошнота, рвота, высокая температура, лихорадка, потеря слуха, спутанность сознания, гангрена. Это связано с тем, что при бразильском штамме у пациентов увеличивается риск возникновения тромбов в кровеносных сосудах кишечника, рук и ног.
Менее угрожающие штаммы
Буквы «эта», «йота», «каппа» и «лямбда» ВОЗ определили как менее угрожающие в эпидемиологическом плане штаммы. представляющим научный интерес:
«эта» – нигерийский штамм (B.1.525);
«йота» – американский штамм (B.1.526);
«каппа» – индийский штамм (B.1.617);
«лямбда» – перуанский штамм (C.37).
Однако лямбда-вирус вызывает у мирового научного сообщества всё больше беспокойства. До сих пор Лямбда была распространена только в странах Латинской Америки: Чили, Перу, Аргентину и Эквадор. На днях первых инфицированных такой мутацией коронавируса выявили в Великобритании.
Линия Лямбда имеет 8 ключевых мутаций. Молекулярный биолог Константин Семёнов в интервью для издания «Московский комсомолец» предположил, что именно из-за этого вирус устойчив к антителам, полученным человеком после вакцинации или после естественной инфекции.
По мнению молекулярного биолога и биотехнолога индийского Университета Мадраса доктора Прийома Бозе, лямбда-вирус ещё и передаётся от человека к человеку гораздо быстрее.
Однако учёные считают, что повышенная вирусная инфекционность не всегда является свидетельство того, что вирус будет быстро и масштабно распространяться. Например, вариант Эпсилон ВОЗ признали не представляющим опасности. Так как на фоне своей высокой способности к заражению он не смог распространиться в человеческой популяции.
Фото: Министерство здравоохранения Кировской области
Сколько штаммов коронавируса в России?
О том, сколько штаммов коронавируса есть в России, точно неизвестно. Из известных штаммов в РФ были выявлены британский, южноафриканский, индийский и несколько локальных.
По словам Руководителя научной группы разработки новых методов диагностики заболеваний человека Центрального научно-исследовательского института эпидемиологии Роспотребнадзора Камиля Хафизова, нельзя точно сказать, что у человека есть иммунитет к определённому штамму коронавируса. Именно поэтому возможно, что вакцины против COVID-19 придётся периодически обновлять и иммунизироваться ежегодно, как это сейчас происходит с тем же вирусом гриппа.
– Думаю, к осени мы накопим достаточное количество данных по эффективности существующих вакцин против новых штаммов. Потому еще раз говорю: на данный момент известных причин избегать вакцинации нет, если только нет прямых противопоказаний по состоянию здоровья, – отметил Камиль Хафизов.
1. Основных штаммов нового коронавируса семь. Ранее штаммы ассоциировали с географическим названиям. Чтобы не дискредитировать соответствующие страны, ВОЗ приняли решение сменить классификацию на буквенную: GR, G, GH, O, S, L и V. Началась пандемия со штамма L – именно его обнаружили в китайском Ухане в декабре 2019 года. В настоящее время учёные выделяют 4 наиболее опасных штамма COVID-19.
2. Штамм «Альфа» – один из самых распространённых в странах Европы вариантов коронавируса, но не в России. Штамм распространяется на 56-70% быстрее исходника. Инфицированные британским штаммом редко теряют вкус и обоняние. В основном у заразившихся им распространены кашель, боль в горле, усталость, мышечные боли и лихорадка.
3. Штамм «Бета» устойчив к антителам в плазме крови, донорами которой были пациенты, уже переболевшие коронавирусной инфекцией. Бета-штамм активно распространяется среди молодых людей. В ВОЗ подтвердили его повышенную заразность.
4. Штамм «Гамма», по данным экспертов, является более заразным и опасным для молодых людей, а также снижает эффективность вакцин. При гамма-штамме болезнь имеет стандартные симптомы ковида. Также он умеет преодолевать естественный иммунитет уже переболевшего населения. В России гамма-вариант пока представлен единичными случаями.
5. Больные индийским штаммом «Дельта» чаще жалуются на головную боль, боль в горле, повышенную температуру, кашель и насморк, для них совсем не характерна потеря обоняния. При тяжёлом протекании болезни у пациента могут появится сильные боли в суставах, тошнота, рвота, потеря слуха, гангрена. Это связано с тем, что при бразильском штамме у пациентов увеличивается риск возникновения тромбов в кровеносных сосудах кишечника, рук и ног. Антитела, появившиеся у переболевшего COVID-19 человека, могут быть неэффективными в борьбе с этим штаммом.
6. Менее угрожающими штаммами ВОЗ считают: «эта» – нигерийский штамм; «йота» – американский штамм; «каппа» – индийский штамм; «лямбда» – перуанский штамм. Однако лямбда-вирус вызывает у мирового научного сообщества достаточно беспокойства. Ранее Лямбда была распространена только в странах Латинской Америки, но на днях первых инфицированных такой мутацией коронавируса выявили в Великобритании.
7. О том, сколько штаммов коронавируса есть в России, точно неизвестно. Из известных штаммов в РФ были выявлены британский, южноафриканский, индийский и несколько локальных.
Если у вас есть вопросы, на которые вы не можете найти ответ, задайте их нам, и мы постараемся на них ответить.